Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4T4

ARHGEF39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF39Q8N4T4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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ARHGEF39Q8N4T4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ARHGEF39Q8N4T4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ARHGEF39Q8N4T4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ARHGEF39Q8N4T4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ARHGEF39Q8N4T4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ARHGEF39Q8N4T4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ARHGEF39Q8N4T4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ARHGEF39Q8N4T4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ARHGEF39Q8N4T4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARHGEF39Q8N4T4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms