Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms