Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BRINP3Q76B58 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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