Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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