Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms