Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms