Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms