Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms