Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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RTL8BQ17RB0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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RTL8BQ17RB0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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RTL8BQ17RB0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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RTL8BQ17RB0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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RTL8BQ17RB0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RTL8BQ17RB0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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