Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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PTPROQ16827 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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PTPROQ16827 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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PTPROQ16827 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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PTPROQ16827 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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PTPROQ16827 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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PTPROQ16827 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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PTPROQ16827 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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