Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms