Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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ECM1Q16610 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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ECM1Q16610 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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ECM1Q16610 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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ECM1Q16610 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
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ECM1Q16610 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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ECM1Q16610 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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ECM1Q16610 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
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ECM1Q16610 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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