Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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ZIC1Q15915 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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ZIC1Q15915 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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