Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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