Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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