Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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