Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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