Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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