Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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