Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ERV3-1Q14264 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ERV3-1Q14264 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ERV3-1Q14264 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ERV3-1Q14264 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ERV3-1Q14264 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ERV3-1Q14264 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ERV3-1Q14264 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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