Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms