Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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