Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms