Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNW1Q13573 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms