Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SRSF6Q13247 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SRSF6Q13247 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SRSF6Q13247 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SRSF6Q13247 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SRSF6Q13247 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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