Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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NME3Q13232 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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NME3Q13232 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME3Q13232 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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NME3Q13232 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NME3Q13232 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NME3Q13232 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NME3Q13232 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
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NME3Q13232 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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NME3Q13232 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME3Q13232 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME3Q13232 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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NME3Q13232 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME3Q13232 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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NME3Q13232 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME3Q13232 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NME3Q13232 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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NME3Q13232 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME3Q13232 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME3Q13232 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME3Q13232 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME3Q13232 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NME3Q13232 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME3Q13232 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME3Q13232 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME3Q13232 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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