Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCP2Q13094 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LCP2Q13094 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
LCP2Q13094 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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