Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
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TRAF1Q13077 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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TRAF1Q13077 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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TRAF1Q13077 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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TRAF1Q13077 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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TRAF1Q13077 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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