Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms