Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms