Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
POLEQ07864 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
POLEQ07864 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
POLEQ07864 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
POLEQ07864 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
POLEQ07864 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
POLEQ07864 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
POLEQ07864 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
POLEQ07864 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
POLEQ07864 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
POLEQ07864 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
POLEQ07864 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
POLEQ07864 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
POLEQ07864 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
POLEQ07864 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
POLEQ07864 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
POLEQ07864 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
POLEQ07864 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms