Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms