Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms