Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms