Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms