Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms