Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms