Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms