Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBSQ01459 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms