Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms