Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms