Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
COG7P83436 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COG7P83436 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
COG7P83436 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COG7P83436 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
COG7P83436 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COG7P83436 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COG7P83436 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COG7P83436 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COG7P83436 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COG7P83436 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COG7P83436 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COG7P83436 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COG7P83436 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COG7P83436 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COG7P83436 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COG7P83436 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COG7P83436 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG7P83436 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COG7P83436 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms