Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms