Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms