Protein–RNA interactions for Protein: P61006

RAB8A, Ras-related protein Rab-8A, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8AP61006 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RAB8AP61006 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RAB8AP61006 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RAB8AP61006 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RAB8AP61006 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RAB8AP61006 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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RAB8AP61006 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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RAB8AP61006 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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RAB8AP61006 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB8AP61006 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB8AP61006 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB8AP61006 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB8AP61006 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB8AP61006 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB8AP61006 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB8AP61006 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB8AP61006 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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