Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSX2P58304 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms