Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms