Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TPD52P55327 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TPD52P55327 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TPD52P55327 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPD52P55327 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPD52P55327 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms