Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ME1P48163 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ME1P48163 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ME1P48163 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ME1P48163 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ME1P48163 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ME1P48163 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ME1P48163 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ME1P48163 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ME1P48163 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ME1P48163 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ME1P48163 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ME1P48163 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ME1P48163 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ME1P48163 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ME1P48163 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ME1P48163 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ME1P48163 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ME1P48163 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms