Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV4P43268 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV4P43268 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV4P43268 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV4P43268 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV4P43268 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV4P43268 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV4P43268 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV4P43268 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV4P43268 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV4P43268 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV4P43268 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV4P43268 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV4P43268 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV4P43268 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV4P43268 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms